目前西医治疗多采用保守治疗和手术治疗两种方法：
1、保守治疗多采用假孕或假绝经疗法，如达哪唑和三苯氧胺、内美通、普维拉等，人为的造成月经停止来潮形成假孕状态，不来月经就没有痛经，但该类药副作用较大，并对肝肾有一定的损害，一些病人当病尚未治愈但由于副作用，只得停药，停药后月经仍会来潮，病情一般会继续发展。
2、手术治疗分两种：
（1）根治性手术，即将两侧性功能障碍和泌尿感染全部切除，这对年轻和未生育的妇女是极其残酷的，所引起的并发症、后遗症给患者身心造成一定的痛苦，术后会发生绝男性不育综合症。
（2）保守性手术，将病变部位局部切除、剥离、剔除，但由于该病粘连很重，往往手术不彻底，如已经异位到骶韧带，侵润到直肠的异位病灶电灼后，复发率高。
腹腔镜即是一种诊断方法，又可以进行治疗，但术后复发机会较多，目前西医对该病确诊较容易， 但治疗上也很棘手。
