一、悬滴法：
悬滴法是检查生殖毛滴虫最简单方法，阳性率可达80%-90%。将检体涂在载玻片上，再加1滴阴茎盐水后加盖玻片，用100-200倍镜检，可见原虫鞭毛波动膜活动。在阴茎盐水中加5%的中性红，滴虫不能死亡，并不着色，而周围形成粉红色，对白色的原虫易于认出，或用1600倍吖啶橙液1滴滴入新鲜标本上，用荧光显微镜观察，可见虫体带有淡黄绿色的荧光，特别好看，直接镜检法检出率极高。
二、涂片染色法
将分泌物涂在玻片上，待自然干燥后可用不同染液染色，如革兰染色，瑞特染色，姬姆萨染色，PAS染色和利什曼染色。这种方法不仅可看到滴虫的形状和内容，而且能同时看到生殖内存在的其他微生物。也可用吖啶橙染色，荧光显微镜检查。
三、培养法
将生殖分泌物或尿道分泌物加入培养基内，置37℃温箱中培养48小时，每隔72小时接种1次，取培养混匀液1滴涂片，染色镜检。
四、免疫学方法
检测生殖毛滴虫特定的抗原。常用的免疫学方法有荧光抗体检查法，ELISA法，胶乳凝集法等，其阳性率较涂片法高，但临床一般不采用免疫学方法检查。
