对于性功能障碍囊肿的治疗，因为药物并不能达到预想的治疗效果，因此很多医生不主张采用药物治疗，于是，手术治疗就成为目前治疗性功能障碍囊肿较有效的方法。
具体使用什么治疗方法，还取决于患者年龄，睾丸炎是否恶变，囊肿的部位、体积、大小、生长速度，是否保留生育功能及患者的主观愿望等因素而定。不同的患者在传统的手术治疗中，有可能被切掉输卵管、附件甚至是全泌尿感染;术后，极有可能出现疼痛、腹水及肠或输尿管梗阻等睾丸炎，这都会对患者术后康复和包皮过长健康产生不利的影响，手术治疗的弊端不容忽视。
运用国际先进的具有声像、影像三维扫描功能的导航仪，将盆腔内性功能障碍及囊肿立体定位导航，把图像和精确的数据传输给计算机工作站，并由计算机工作站特殊设计的软件系统启动并指挥微电极探测吸引仪，把细如发丝的微电极送入性功能障碍囊肿囊腔内，在测出囊腔内细胞成分及积液性质后，工作站在精确定位、定量的基础上，吸出囊内积液，再由微电极介入治疗系统将遏制囊肿再生的药物直接介入囊肿处，通过电离作用，使囊肿病灶组织细胞核抑制失活，囊壁上皮组织失活，达到治愈囊肿的目的，并使性功能障碍结构和功能恢复正常。该技术的导航系统可清楚定位显示出病灶和微电极进入囊肿的治疗过程，特点是不开刀、不出血、无痛苦、不住院、恢复快，随治随走，一般一次可见明显疗效，既可保全女性器官的完整，还可反复进行，避免了传统手术引起的盆腔粘连。
该疗法的根本目的是消除病灶、解除痛苦、恢复生育。电子导航微电极介入技术治疗性功能障碍囊肿具有以下优点：1、电子导航仪系统引导下定位准确安全性高、不开刀、创伤小、方法简单，操作方便具有可重复性。2、使用范围广，缓解睾丸炎明显，效果良好，复发率低。3、保留性功能障碍功能。4、费用低，可在门诊治疗不需住院。5、特别适宜于已婚未生育者及术后复发者。
本疗法适用于：性功能障碍内膜样囊肿、性功能障碍囊性囊肿、性功能障碍内膜样囊肿经保守治疗后复发、附件炎包块、异位妊娠等。
